4號線一期新牌坊至唐家沱 設9個車站 6個換乘站
軌道4號線一期起於新牌坊站，終於唐家沱，線路全長約17.6公裏，東西走向，設車站9座，依次為新牌坊站、民安大道站、火車北站、蝦子蝙站、金山站、寸灘站、黑石子站、唐棟橋站、唐家沱站。
沿途將與其他5條軌道線路換乘。其中，新牌坊站將與3號線換乘，民安大道站與環線換乘，重慶北站與10號線換乘，金山站、蝦子蝙站與9號線換乘，唐棟橋站與規劃的11號線換乘。
5號線一期園博園至跳磴 設車站25座 9個換乘站
軌道5號線一期起於北部新區園博園，止於大渡口區跳磴，線路長約39.7公裏，南北走向，設車站25座，分別是園博中心站、丹鶴站、湖霞街站、重光站、和睦路站、人和站、幸福廣場站、冉家壩站、大龍山站、大石壩站、忠恕沱站、紅岩村站、歇台子站、石橋鋪站、石新路站、巴山站、鳳西路站、重慶西站、華岩寺站、華成路站、半山站、中梁山站、華岩新城站、石龍站、跳磴站。
沿途將與其他7條軌道線路實現換乘。分別是在湖霞街站與15號線換乘，冉家壩站與6號線、環線換乘，大龍山站與6號線換乘，紅岩村站與9號線換乘，歇台子站與5號線支線換乘，石橋鋪站與1號線換乘，重慶西站與環線、12號線換乘，半山站與2號線支線換乘，跳磴站與5號線支線換乘。
預留跨線運行通道 實現不下車換乘
軌道4、5號線在建設中，將根據條件預留跨線運行通道，以滿足不同線路之間車輛過軌需求。即今後乘客乘坐4、5號線或可通過列車換軌道達到不下車換乘的目的。
此外，軌道4、5號線建成後，將改善主城區交通尤其是跨江交通狀況，有效緩解主城區交通壓力。同時，兩條軌道線路分別連接火車北站、重慶鐵路西客站，可實現軌道交通與火車站之間的便捷換乘。
